The present invention relates to a system and method of computer assisted surgery in soft tissue. The system comprises a navigated instrument (14) suitable to be inserted into a living objects soft tissue body part, wherein said navigated instrument (14) when inserted into the body part is suitable to define at least a portion of a section plane with respect to said soft tissue body part. The system further comprises a computer assisted guiding means to assist or enable guiding the instrument (14) upon insertion into the body part such that the section plane defined by said inserted instrument (14) coincides with a planned section plane.La présente invention porte sur un système et sur un procédé de chirurgie assistée par ordinateur dans un tissu mou. Le système comprend un instrument de navigation (14) approprié pour être introduit dans une partie de corps de tissu mou dun objet vivant, ledit instrument de navigation (14), lorsquil est introduit dans la partie de corps, étant approprié pour définir au moins une partie dun plan en coupe par rapport à ladite partie de corps de tissu mou. Le système comprend en outre un moyen de guidage assisté par ordinateur destiné à aider ou à permettre un guidage de linstrument (14) lors de lintroduction dans la partie de corps, de telle sorte que la section en coupe définie par ledit instrument inséré (14) coïncide avec un plan en coupe planifié.