PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a particle beam therapy system capable of measuring a stopping power ratio distribution with high accuracy, a measured particle beam CT image generation method, and a CT image generation program without increasing the size of a treatment device. SOLUTION: As a charged particle beam, a proton beam and a helium beam can be irradiated, and the energy of the proton beam transmitted through the patient 5 is measured by a residual range measuring device 81 and a residual range measuring device 81. The patient 5 is provided with a particle beam CT image generator 80 for obtaining a stopping power distribution for a proton beam and calculating a stopping power distribution for a helium beam based on the obtained stopping power distribution. [Selection diagram] Fig. 1【課題】治療装置を大型化することなく、高精度な阻止能比分布の計測が可能な粒子線治療システム、計測粒子線CT画像生成方法、およびCT画像生成プログラムを提供する。【解決手段】荷電粒子線として、陽子線およびヘリウム線を照射可能であり、患者5を透過した陽子線のエネルギーを計測する残飛程計測装置81と、残飛程計測装置81によって計測された患者5の陽子線に対する阻止能比分布を求め、求めた阻止能比分布に基づいてヘリウム線に対する阻止能比分布を演算する粒子線CT画像生成装置80と、を備えている。【選択図】 図1