本发明涉及一种调控木材发育的相关基因及其应用。具体地，本发明提供了一种新的PtMAN6多肽或其编码序列，所述PtMAN6多肽的氨基酸序列如SEQ IDNO.:2所示，所述编码序列如SEQ ID NO.:1所示。本发明还提供了PtMAN6基因及其编码的蛋白的用途，它们可降低木质部次生细胞壁合成和/或降低结晶纤维生物质的积累；过量表达PtMAN6可以在植物中富集降解甘露聚糖类半纤维素的甘露聚糖水解酶，同时由于PtMAN6的调控作用，转基因植株中木质素含量降低，结晶纤维素降低，大大降低了木质纤维素乙醇生产和造纸工业中的成本；PtMAN6基因的启动子具有特异的导管细胞定位功能，能精确调控基因在木质部导管细胞中的表达。
