Methods, systems, and apparatus, including computer-readable storage media, for surgical alignment using references. In one general aspect, a method includes coupling a guide to a joint, the guide defining an axis and having an outer contour formed to substantially conform to a portion of the joint. The first reference is attached at a fixed position relative to the joint. A positioning system is used to determine a position of the axis relative to the first reference, where the position of the axis is determined based upon the position of the guide while the guide is coupled to the joint. The guide is removed from the joint, and after the guide is removed from the joint, an instrument is positioned relative to the axis based on a position of a second reference relative to the first reference.L'invention concerne des procédés, des systèmes et un appareil, comprenant des supports de stockage lisibles par ordinateur, pour un alignement chirurgical à l'aide de références. Selon un aspect général, un procédé consiste à coupler un guide à une articulation, le guide définissant un axe et ayant un contour externe formé pour se conformer sensiblement à une partie de l'articulation. La première référence est fixée à une position fixe par rapport à l'articulation. Un système de positionnement est utilisé pour déterminer une position de l'axe par rapport à la première référence, la position de l'axe étant déterminée sur la base de la position du guide pendant que le guide est couplé à l'articulation. Le guide est retiré de l'articulation, et après que le guide est retiré de l'articulation, un instrument est positionné par rapport à l'axe sur la base d'une position d'une seconde référence par rapport à la première référence.
