The present invention provides a method for producing process seeding which inoculates live bacteria for phytoremediation, comprising: a step for culturing endophytes which produces siderophores and comprises a tolerance for heavy metal on a badge; a step for performing an overhead flooding treatment for the culture fluid of the endophytes in the seed or the shoot of a plant body; and a step for growing the seed or the shoot in which the culture fluid of the endophytes is processed and growing the same to the plant body.본 발명은 사이드로포어를 생산하며 중금속에 내성을 갖는 엔도파이트(endophytes)를 배지에 배양하는 단계; 상기 엔도파이트의 배양액을 식물체의 종자 또는 묘에 관수처리하는 단계; 및 상기 엔도파이트 배양액이 처리된 종자 또는 묘를 생육시켜 식물체로 생장시키는 단계를 포함하는 식물재배정화용 내생균 접종 공정육묘의 생산 방법을 제공한다.