The present invention relates to a method for preparing an extract containing omega fatty acids from a plant containing omega fatty acids, including the following steps: drying the plant containing omega fatty acids to prepare a powder; and extracting omega fatty acids from the prepared plant powder by using supercritical carbon dioxide as a solvent at an optimum temperature and pressure, a dietary supplement and a cholesterol-lowering pharmaceutical composition containing plant-derived omega fatty acids extracted by the method, and omega fatty acids-containing plant extract containing a predetermined or greater amount of omega-3 fatty acids.본 발명은 오메가 지방산 함유 식물을 건조하여 분말로 제조하는 단계; 및 상기 제조된 식물 분말로부터 초임계 이산화탄소를 용매로 사용하고, 최적 온도 및 최적 압력에서 오메가 지방산을 추출하는 단계를 포함하는 오메가 지방산 함유 식물로부터 오메가 지방산 함유 추출물의 제조방법, 상기 방법에 의해 추출된 식물 유래 오메가 지방산을 함유하는 건강기능식품 및 콜레스테롤 저하용 약학 조성물, 및 오메가-3 지방산의 함량이 일정량 이상 함유되는 오메가 지방산 함유 식물 추출물에 관한 것이다.