Provided is an MTSP-1 polypeptide that inhibits complement activation by cleaving a complement protein, such as complement protein C3, by modifying it to have altered activity and / or specificity, and inhibiting its activity. Modified MTSP-1 polypeptides that inhibit complement activation can be used to treat diseases and conditions in which complement activation plays a role. Such diseases and conditions include inflammatory diseases and disorders with inflammatory components. Exemplary such disorders include ischemic and reperfusion disorders, including myocardial infarction and stroke, ophthalmic disorders such as sepsis, autoimmune diseases, diabetic retinopathy and macular degeneration, including aging-related macular degeneration (AMD), and kidney transplant renal impairment. (DGF).변경된 활성 및/또는 특이성을 가지도록 변형됨으로써 보체 단백질 C3과 같은 보체 단백질을 절단하고, 이의 활성을 억제함으로써 보체 활성화를 억제하는 MTSP-1 폴리펩티드가 제공된다. 보체 활성화를 억제하는 변형된 MTSP-1 폴리펩티드는 보체 활성화가 역할을 하는 질환 및 상태의 치료에 사용될 수 있다. 이러한 질환 및 상태는 염증 구성성분을 갖는 염증 질환 및 질환들을 포함한다. 예시적인 이러한 장애는 심근 경색 및 뇌졸중을 포함하는 허혈성 및 재관류 장애, 패혈증, 자가면역 질환, 노화-관련 황반변성(AMD)을 포함하는 당뇨병성 망막증 및 황반변성과 같은 안과 장애, 및 신장 이식 신장 기능지연(DGF)과 같은 이식된 장기 거부를 포함한다.