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基于人工鱼群优化算法识别关键蛋白质的方法
专利权人:
陕西师范大学
发明人:
雷秀娟,杨晓琴,代才,程适
申请号:
CN201710912037.5
公开号:
CN107784196A
申请日:
2017.09.29
申请国别(地区):
中国
年份:
2018
代理人:
徐文权
摘要:
本发明公开了一种基于人工鱼群优化算法识别关键蛋白质的方法,将蛋白质相互作用网络转化为无向图、构建提纯的蛋白质相互作用网络、获取蛋白质对应的核糖核酸基因表达值、GO注释信息以及蛋白质在已知复合物内的度,对提纯后的蛋白质相互作用网络边和结点进行处理、选取已知关键蛋白质作为初始人工鱼、人工鱼执行觅食行为、随机行为、追尾行为、聚群行为并产生关键蛋白质。本发明方法能准确地识别关键蛋白质;仿真实验结果表明,敏感度、特异性、阳性预测值、阴性预测值等指标性能较优;与其他关键蛋白质识别方法相比,将人工鱼群的优化特性与蛋白质相互作用网络的拓扑特征进行结合实现关键蛋白质的识别过程,提高了关键蛋白质的识别准确率。
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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