EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LAB;サントル ナシオナル ドゥ ラ ルシェルシェ シアンティフィーク;ユニヴェルシテ ジョセフ フーリエ フィリエール;ヨーロピアン モレキュラー バイオロジー ラボラトリー;CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE;UNIV JOSEPH FOURIER FILIALE
PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a polypeptide fragment or a variant thereof in which the PA subunit of a viral RNA dependent RNA polymerase having an endonuclease activity is derived from a virus belonging to Orthomyxoviridae.SOLUTION: The amino terminal fragment of the PA subunit has at least 90% sequence identity to a specific amino terminal fragment or the full length of the fragment, and holds an endonuclease activity. This invention relates to (i) crystals of the polypeptide fragments which are suitable for structure determination of the polypeptide fragments using X-ray crystallography, and (ii) methods using the structural coordinates of the polypeptide to screen for and identify compounds that modulate, preferably inhibit the endonucleolytically active site within the polypeptide fragment.【課題】エンドヌクレアーゼ活性を有するウイルスＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼのＰＡサブユニットがオルトミクソウイルス科に属するウイルス由来のものである、ポリペプチド断片又はその変異体の提供。【解決手段】ＰＡサブユニットのアミノ末端断片は、特定のアミノ末端断片又はその断片の全長と少なくとも９０％の配列同一性を有し、かつエンドヌクレアーゼ活性を保持する。（ｉ）Ｘ線結晶学を使用する上記ポリペプチド断片の構造決定に好適なポリペプチド断片の結晶、並びに（ｉｉ）上記ポリペプチドの構造座標を使用して該ポリペプチド断片内のヌクレオチド鎖切断活性部位を変調させるか、好ましくは阻害する化合物のスクリーニング、及び、化合物を同定する方法。【選択図】なし
