本发明属于生物工程技术领域,具体涉及一种拟除虫菊酯降解酶编码基因,所述编码基因YLL2‑C244A的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;还提供了含上述的拟除虫菊酯降解酶的编码基因YLL2‑C244A的重组菌株YLL2‑X33以及由上述重组菌株YLL2‑X33表达得到的拟除虫菊酯降解酶。本发明还提供上述编码基因YLL2‑C244A在制备拟除虫菊酯类农药降解酶方面的应用、上述拟除虫菊酯降解酶在降解拟除虫菊酯类农药方面的应用以及采用上述重组菌株YLL2‑X33经摇瓶培养、发酵培养、过滤、防腐,得到拟除虫菊酯降解酶酶液的方法。本发明的拟除虫菊酯降解酶降解菊酯范围广,降解效果相对明显,对蔬果上残留的常见拟除虫菊酯的降解率平均达85%以上,可用于食品或环境中菊酯类农药残留的降解。