本发明公开了一种用于TRV介导的基因沉默系统中的指示基因,其核酸序列如SEQ ID No:1所示,还公开了含有该序列的病毒诱导沉默载体及其构建方法,并利用该沉默载体侵染柑橘幼苗的方法。本发明为TRV介导的病毒诱导基因沉默体系提供有效的指示基因,是首次在柑橘中成功建立TRV介导的病毒沉默系统,成功地沉默了柑橘中的指示基因。利用本发明的沉默载体构建的沉默系统操作简单、转化效率高、能够快速地在柑橘中对基因进行功能验证。能够有效地抑制柑橘中的内源基因表达,表型显著。本发明提供的沉默载体为快速、有效地在柑橘中进行基因功能验证提供了可靠技术。