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一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法
- 专利权人:
- 中国水产科学研究院南海水产研究所
- 发明人:
- 张殿昌,朱克诚,刘田田,江世贵,张楠,郭华阳
- 申请号：
- CN201610072778.2
- 公开号：
- CN105695572A
- 申请日:
- 2016.02.02
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 宣国华`马赟斋
- 摘要：
- 本发明公开了一种基于Indel和SSR位点技术大批量且高效开发分子标记的方法，包括以下步骤：(1)选取至少3个待开发样品，分别提取待开发样品的DNA；(2)对各待开发样品的DNA样品进行酶切并构建测序文库并测序；(3)所有待开发样品的基因组混合后进行组装获得Contigs；(4)利用Contigs与各待开发样品个体序列进行比对，根据Indel和SSR的位点信息，获得内部存在Indel的SSR位点，作为候选多态性SSR位点；(5)根据获得的候选多态性SSR位点设计引物，PCR扩增和测序，选取带型稳定清晰条带，作为待验证分子标记引物；(6)利用所得的分子标记引物，PCR扩增不同的待开发样品，选取具有多样性的分子标记，获得分子标记。该方法提高分子标记开发的效率，且开发的SSR分子标记能高效应用于遗传学、增殖放流评估等方面的研究。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
