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一种大批量开发SSR分子标记的方法
- 专利权人:
- 中国农业科学院麻类研究所
- 发明人:
- 邓欣,王玉富,陈信波,龙松华,邱财生
- 申请号：
- CN201510232342.0
- 公开号：
- CN104830832A
- 申请日:
- 2015.05.09
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2015
- 代理人:
- 王培苓
- 摘要：
- 本发明涉及一种大批量开发SSR分子标记的方法，其包括1获取基因组测序序列或GenBank上的EST序列；2获得基因组测序序列或GenBank上的EST序列的SSR位点信息；3按照SSR基序类型对SSR位点进行归类；4对数据库3.CSV的SSR位点信息进行反向互补处理；5使用SSR位点序列截取软件获取数据库4.CSV和数据库5.CSV中的SSR分子标记及上下游序列并按基序类型建立序列数据库；6筛选同类型SSR的CSV文件中重复或相似的SSR位点。本方法可以定位基因组中的SSR标记位点，批量截取SSR序列片段，并对不同的SSR序列进行重复性分析，大大提高SSR分子标记的开发效率。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
