The present invention has at least one of two gene clusters comprising a gene group encoding a protein constituting the ABC transporter, preferably both in the genome, and is transported into the cell by the ABC transporter. Provided is an intestinal barrier function improving agent comprising, as an active ingredient, live cells of intestinal resident bacteria having an ability to produce an acetate from a saccharide. Also provided is a method for screening a microorganism having an action of improving the intestinal barrier function, using the presence or absence of the gene cluster in the genome as an index.本発明は、ABCトランスポーターを構成する蛋白質をコードする遺伝子群を含んでなる2つの遺伝子クラスターの少なくとも一方、好ましくは両方をゲノム中に有し、かつ該ABCトランスポーターにより細胞内に輸送される糖類から酢酸塩を生成する能力を有する腸内常在菌の生細胞を有効成分とする、腸管バリア機能改善剤を提供する。また、ゲノム中の該遺伝子クラスターの有無を指標とする、腸管バリア機能改善作用を有する微生物のスクリーニング方法も提供される。