The present invention relates to a medical apparatus and a method thereof. According to an embodiment of the present invention, an acquisition unit acquires a transparent image of a subject from a photographing unit for generating the transparent image by irradiating an electromagnetic wave to the subject to photograph the same. A specification unit specifies a target position of the subject in the transparent image. A control unit outputs an irradiation allowance signal to a treatment device which irradiates a treatment beam to the subject when the target position specified by the specification unit enters an irradiation allowance range. Also, the control unit stops the irradiation of the electromagnetic wave of the photographing unit and stops acquisition of the transparent image by the acquisition unit when a first switch is manipulated. In addition, the control unit stops the irradiation of the electromagnetic wave of the photographing unit, and maintains a state capable of acquiring the transparent image by the acquisition unit when a second switch is manipulated.실시형태에 의하면, 취득부는, 전자파를 피검체에 조사(照射)하여 촬영함으로써 투시 화상을 생성하는 촬영부로부터, 상기 피검체의 투시 화상을 취득한다. 특정부는, 상기 투시 화상에 있어서의 상기 피검체의 타깃 위치를 특정한다. 제어부는, 상기 특정부에 의해 특정된 타깃 위치가 조사 허가 범위 내에 들어갈 경우에, 상기 피검체에 치료 빔을 조사하는 치료 장치에 조사 허가 신호를 출력한다. 상기 제어부는, 제1 스위치가 조작되었을 경우에, 상기 촬영부에 상기 전자파의 조사를 정지시킴과 함께 상기 취득부에 의한 상기 투시 화상의 취득을 정지시킨다. 상기 제어부는, 제2 스위치가 조작되었을 경우에, 상기 촬영부에 상기 전자파의 조사를 정지시킴과 함께 상기 취득부에 의한 상기 투시 화상의 취득이 가능한 상태를 유지한다.