The present invention relates to a method for manufacturing a functional food composition, which comprises the following steps: preparing at least one first main ingredient selected from pine, pine needles, and pine cones, a second main ingredient of dried Artemisia vulgaris, and a third main ingredient of dried Pueraria montana performing a softening process for cutting or pulverizing the main ingredients performing a leaching process for firstly ripening the main ingredients, by using an alcohol solution with an amount, capable of leaching the main ingredients extracting an undiluted solution after the leaching process and secondarily ripening the extracted undiluted solution.본 발명의 기능성 식품 조성물의 제조 방법은, 솔잎, 솔방울 및 솔순 중 선택되는 적어도 하나 이상의 제 1 주재료와, 건조된 쑥의 제 2 주재료와, 건조된 칡의 제 3 주재료를 준비하는 단계와, 상기 주재료를 절단하거나 분쇄하는 연화 공정을 수행하는 단계와, 상기 주재료들을 침전시킬 수 있는 양의 알콜 용액을 사용하여, 상기 주재료의 1차 숙성하기 위한 침출 공정을 수행하는 단계와, 상기의 침출 공정 후에, 여과 분리하여 원액을 추출하는 단계와, 상기의 추출된 원액에 대하여 2차 숙성하는 단계를 포함한다.