This invention relates generally to the detection of genetic differences among soybeans. More particularly, soybean quantitative trait loci (QTL) associated with herbicide tolerance, including tolerance to one or more of an HPPD-inhibitor herbicide, such as mesotrione and isoxazole herbicides, and/or a PPO inhibitor herbicide; soybean plants possessing these QTLs; and genetic markers that are indicative of phenotypes associated with such herbicide tolerance are provided. Methods and compositions for use of these markers in genotyping of soybean and selection are also disclosed, as are methods and compositions for use of herbicides for weed control. Also disclosed are isolated polynucleotides and polypeptides relating to such tolerance or sensitivity and methods of introgressing such tolerance into a plant by breeding or transgenically, or by a combination thereof. Plant cells, plants, and seeds produced are also provided.La présente invention concerne, de façon générale, la détection de différences génétiques au sein de plants de soja, et, en particulier, de locus à caractère quantitatif (QTL) propres au soja associés à la tolérance aux herbicides, dont la tolérance à un ou plusieurs herbicides inhibiteurs de la HPPD, comme la mésotrione et l'isoxazole, et/ou à un herbicide inhibiteur de la PPO ; des plants de soja possédant lesdits QTL ; et des marqueurs génétiques révélateurs des phénotypes associés à ladite tolérance aux herbicides. L'invention concerne également des procédés et des compositions utilisant lesdits marqueurs dans le cadre du génotypage du soja et de la sélection, ainsi que des compositions utilisables en tant qu'herbicides dans le cadre de la lutte contre les mauvaises herbes et des procédés associés. L'invention concerne, en outre, des polynucléotides et des polypeptides isolés associés à ladite tolérance ou sensibilité et des procédés d'introgression de ladite tolérance dans une plante par sélection ou par voie transgénique, ou par une combinaiso