This invention relates generally to the detection of genetic differences among soybeans. More particularly, soybean quantitative trait loci (QTL) associated with herbicide tolerance, including tolerance to one or more of an HPPD-inhibitor herbicide, such as mesotrione and isoxazole herbicides, and/or a PPO inhibitor herbicide; soybean plants possessing these QTLs; and genetic markers that are indicative of phenotypes associated with such herbicide tolerance are provided. Methods and compositions for use of these markers in genotyping of soybean and selection are also disclosed, as are methods and compositions for use of herbicides for weed control. Also disclosed are isolated polynucleotides and polypeptides relating to such tolerance or sensitivity and methods of introgressing such tolerance into a plant by breeding or transgenically, or by a combination thereof. Plant cells, plants, and seeds produced are also provided.La présente invention porte d'une manière générale sur la détection de différences génétiques parmi les sojas. Plus particulièrement, l'invention porte sur des loci de traits quantitatifs (QTL) du soja, pour une tolérance ou une sensibilité aux herbicides inhibiteurs du HPPD, tels que les herbicides mésotrione et isoxazole, sur des plants de soja possédant ces QTL, qui cartographient une nouvelle région chromosomique, et sur des marqueurs génétiques qui sont une indication des phénotypes associés à une tolérance, à une tolérance améliorée, à une sensibilité ou à une sensibilité accrue. Elle porte aussi sur des procédés et de compositions pour l'utilisation de ces marqueurs dans le génotypage du soja et pour la sélection, ainsi que sur des procédés et des compositions destinés à l'utilisation de ces marqueurs lors de la sélection et de l'utilisation des herbicides pour lutter contre les mauvaises herbes. Elle porte aussi sur des polynucléotides et polypeptides isolés se rapportant à cette tolérance et à cette sensibilité, ainsi que sur des procédés p