A medical image processing device (1) according to the present embodiment is provided with: an input unit (16) which inputs at least three landmarks in each of a first cross-sectional image group and a second cross-sectional image group an axis determination unit (14) which determines a first axis connecting two landmarks among the landmarks, and a second axis that passes another landmark different from the two landmarks among the landmarks and lies at right angles to the first axis in each of the first and second cross-sectional image groups and an alignment unit (22) which, using the first and second axes in the first cross-sectional image group and the first and second axes in the second cross-sectional image group, aligns a plurality of first cross-sectional images belonging to the first cross-sectional image group and a plurality of second cross-sectional images belonging to the second cross-sectional image group with each other.Un dispositif de traitement dimage médicale (1) selon le présent mode de réalisation comprend : une unité dentrée (16) qui saisit au moins trois repères dans chacun dun premier groupe dimages transversales et dun second groupe dimages transversales une unité de détermination daxe (14) qui détermine un premier axe reliant deux repères parmi les repères, et un second axe qui fait passer un autre repère différent des deux repères parmi les repères et est relié, à angles droits, au premier axe dans chacun des premier et second groupes dimages transversales et une unité dalignement (22) qui, à laide des premier et second axes dans le premier groupe dimages transversales et des premier et second axes dans le second groupe dimages transversales, aligne les unes avec les autres une pluralité de premières images transversales appartenant au premier groupe dimages transversales et une pluralité de secondes images transversales appartenant au second groupe dimages transversales.本実施形態に係る医用画像処理装置1は、第1断面画像群と第2断面画像群とにおいて、少なくとも3つの標識点を入力する入力部16と、第1、第2断面