Embodiments of the present invention include surgical instruments and methods for providing an arthroplasty system configured for use with a skeletal structure that may be deformed or that may have a defect. In some embodiments, a patient-compatible surface is prepared to engage the deformity or defect and other reference points or reference surfaces are alignment guides to allow proper placement of the reconstruction system. Provided to give.本発明の実施形態は、変形している場合のあるまたは欠損を有する場合のある骨格構造体と共に使用するように構成された関節形成システムを提供するための外科器具および方法を含む。いくつかの実施形態では、患者適合表面が、変形部または欠損部に係合するように調製され、他の基準点または基準面が、再建システムの適切な配置を可能にするための位置合わせガイドを与えるために設けられる。