Apparatus, systems, and methods are provided that generate in vivo maps of oxygenation measurements of biological tissue. These may include surgical instruments and stand-alone imaging systems with incorporated oxygen sensing capability. Oxygenation maps can be determined via fluorescent or phosphorescent lifetime imaging of an injectable probe with an oxygen-dependent optical response. Probe configuration and methods and apparatus of injecting the probe into the tissue are provided. Methods and apparatus for temperature compensation of temperature-dependent lifetime measurements are provided to improve oxygenation measurement accuracy. Oxygen maps may be registered with visible light images to assist in assessing tissue viability or localize anomalies in the tissue. Resulting oxygen images may be used for various applications including, but not limited to, guiding surgical procedures such as colorectal resection through use of intraoperative sensing, enhanced endoscopic imaging for identifying suspect lesions during colonoscopy, and external imaging of tissue such as assessing peripheral vascular disease.La présente invention concerne un appareil, des systèmes et des procédés qui génèrent des cartes in vivo de mesures d'oxygénation de tissu biologique. Ils peuvent comprendre des instruments chirurgicaux et des systèmes d'imagerie autonomes possédant une capacité de détection d'oxygène incorporée. Des cartes d'oxygénation peuvent être déterminées par imagerie de durée de vie fluorescente ou phosphorescente d'une sonde injectable avec une réponse optique dépendant de l'oxygène. Une configuration de sonde ainsi que des procédés et un appareil d'injection de la sonde dans le tissu sont prévus. Des procédés et un appareil pour la compensation de température des mesures de durée de vie dépendant de la température sont fournis pour améliorer la précision de mesure de l'oxygénation. Des cartes d'oxygène peuvent être enregistrées avec des images de lumière visible pour ai