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Methods for preparing polypeptide libraries
专利权人:
独立行政法人産業技術総合研究所
发明人:
久保 泰,木村 忠史,小野 世吾
申请号:
JP2011503843
公开号:
JPWO2010104114A1
申请日:
2010.03.10
申请国别(地区):
JP
年份:
2012
代理人:
摘要:
The present invention is a polypeptide library for identifying a polypeptide having a high affinity for a desired target, has a scaffold with a relatively small molecule and a small number of cysteine residues, and targets a membrane protein As a polypeptide library applicable to a high-throughput screening system, it is a polypeptide library composed of a group of a plurality of polypeptides having an ICK scaffold, and the amino acid sequence of each polypeptide is the following (i) to A polypeptide library characterized by having an amino acid sequence randomized simultaneously in the region (iv) is provided. (I) the amino acid sequence from the fourth C-terminal side of Cys-1 to the first N-terminal side of Cys-2 in the loop I region between Cys-1 and Cys-2; (ii) Cys-2 and Cys Amino acid sequence from the third C-terminal side of Cys-2 to the first N-terminal side of Cys-3 in the loop II region between -3; (iii) the loop III region between Cys-5 and Cys-6 The amino acid sequence from the second C-terminal side of Cys-5 to the third N-terminal side of Cys-6; and (iv) the C-terminal 3 of Cys-6 in the tail region from Cys-6 to the C-terminal side. Amino acid sequence from the second to the C-terminal.本発明は、所望の標的に親和性の高いポリペプチドを同定するためのポリペプチドライブラリーであって、比較的低分子でシステイン残基の数も少ないスキャフォールドを有し、膜タンパク質を標的としたハイスループットスクリーニング系にも適用可能なポリペプチドライブラリーとして、ICKスキャフォールドを有する複数のポリペプチドの群で構成されるポリペプチドライブラリーであり、かつ当該各ポリペプチドのアミノ酸配列が、下記(i)~(iv)の領域において同時にランダム化されたアミノ酸配列を有していることを特徴とするポリペプチドライブラリーを提供した。(i)Cys-1とCys-2の間のループI領域中のCys-1のC末側4番目からCys-2のN末側1番目までのアミノ酸配列;(ii)Cys-2とCys-3の間のループII領域中のCys-2のC末側3番目からCys-3のN末側1番目までのアミノ酸配列;(iii)Cys-5とCys-6の間のループIII領域中のCys-5のC末側2番目からCys-6のN末側3番目までのアミノ酸配列;および(iv)Cys-6からC末端側のテール領域中のCys-6のC末側3番目からC末端までのアミノ酸配列。
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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