The invention relates to methods for the screening, identification and/or application of microorganisms of use in imparting beneficial properties to plants. In one embodiment, the method involves identifying one or more plant markers associated with a beneficial property, subjecting one or more plants to a growth medium in the presence of a set of microorganisms, selecting one or more plants on the basis that the one or more plant markers is present, acquiring one or more microorganisms associated with the selected plant(s) and repeating the process one or more times.Cette invention concerne des procédés de criblage, didentification et/ou dapplication de micro-organismes pour conférer des propriétés bénéfiques à des plantes. Dans un mode de réalisation, le procédé implique lidentification dun ou de plusieurs marqueurs végétaux associés à une propriété bénéfique, la soumission dune ou de plusieurs plantes à un milieu de croissance en présence dun ensemble de micro-organismes, la sélection dune ou de plusieurs plantes sur la base de la présence du ou des marqueurs végétaux, lacquisition dun ou de plusieurs micro-organismes associés à la plante ou aux plantes sélectionnée(s) et la répétition du procédé une ou plusieurs fois.