本发明公开了一种patatin-like磷脂酶及其编码基因与用途;本发明所述的来源于深海宏基因组的patatin-like磷脂酶基因,该基因大小为912bp,序列如SEQ ID NO.1所示,编码303个氨基酸,序列如SEQ ID NO.2所示,蛋白分子量为33kDa,等电点为6.21。本发明克隆得到了深海plp基因,并首次分析了其产物及摸索出通过基因工程大量制备该酶蛋白的方法。所述PLP蛋白可水解对硝基苯酚乙酸酯pNPA、对硝基苯酚丁酸酯pNPB、对硝基苯酚辛酸酯pNPO、对硝基苯酚癸酸酯pNPDE、对硝基苯酚月桂酸酯pNPDO。本发明提供的PLP可水解脂类物质,具有工业化生产潜力和经济价值。