The invention comprises a virtual window system that creates a visual coherency between the image of the patient and his or her anatomy and the patient by aligning the image of the patient anatomy on the display to the patient and presenting the image to the user that feels as if the user is looking directly into the patient through the display. The invention is designed to also display medical devices, such as a minimally invasive tool. The system substantially unifies the coordinate systems of the patient, the medical device, the display, and the physician's hands. The invention creates a visual coherency between the motion of the medical device in the image and the motion of the physician's hands manipulating the device. This invention also creates a visual coherency between the motion of the image in the display and of that display.L'invention comprend un système de fenêtre virtuelle qui crée une cohérence visuelle entre l'image du patient et son anatomie et le patient par alignement de l'image de l'anatomie de patient sur le dispositif d'affichage avec le patient et présentation de l'image à l'utilisateur qui ressent si l'utilisateur regarde ou non directement dans le patient par l'intermédiaire du dispositif d'affichage. L'invention concerne également des dispositifs médicaux d'affichage, tels qu'un outil minimalement invasif. Le système unifie sensiblement les systèmes de coordonnées du patient, le dispositif médical, le dispositif d'affichage et les mains du médecin. L'invention crée une cohérence visuelle entre le mouvement du dispositif médical dans l'image et le mouvement des mains du médecin manipulant le dispositif. La présente invention crée également une cohérence visuelle entre le mouvement de l'image dans le dispositif d'affichage et le dispositif d'affichage.