A method and apparatus for generating and displaying a 3D representation of a portion an intraoral scene is provided. The method includes determining 3D point cloud data representing a part of an intraoral scene in a point cloud coordinate space. A colour image of the same part of the intraoral scene is acquired in camera coordinate space. The colour image elements are labelled that are within a region of the image representing a surface of said intraoral scene, which should preferably not be included in said 3D representation. A labelled and applicably transformed colour image is then mapped onto the 3D point cloud data, whereby the 3D point cloud data points that map onto labelled colour image elements are removed or filtered out. A 3D representation is generated from said filtered 3D point cloud data, which does not include any of the surfaces represented by the labelled colour image elements.L'invention concerne un procédé et un appareil permettant de générer et d'afficher une représentation 3D d'au moins une partie d'une scène intra-buccale. Le procédé consiste à déterminer une représentation de données en nuage de points en 3D d'une partie d'une scène intra-buccale dans un espace de coordonnées en nuage de points. Une image couleur de la même partie de la scène intrabuccale est acquise dans un espace de coordonnées de caméra. Un étiquetage est effectué sur les éléments d'image couleur qui se trouvent à l'intérieur d'une région de l'image représentant une surface de ladite scène intra-buccale qu'il est préférable de ne pas inclure dans ladite représentation 3D. Typiquement, des éléments d'image sont étiquetés dans une région à l'aide d'une couleur ou d'un motif de couleur correspondant à une couleur de surface ou à un motif de couleur de surface d'un ustensile utilisé par voie intra-buccale lors de l'acquisition desdites données 3D et de l'image couleur. En variante, ou en outre, un étiquetage est effectué sur des éléments qui se trouvent à l'intérieur d'une ré