PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a medical image processing apparatus or the like capable of more accurately executing ovarian follicle segmentation in medical imaging data.SOLUTION: The medical image processing apparatus according to one embodiment comprises extraction means, selection means and determination means. The extraction means extracts regions from the medical image data by performing threshold processing of the medical image data representative of a tissue structure by using each of a plurality of threshold values. The selection means selects regions meeting a predetermined condition from among the extracted regions. The determination means determines a region representative of the tissue structure in the medical image data on the basis of the selected regions.SELECTED DRAWING: Figure 4【課題】医用撮像データにおける卵胞のセグメンテーションを従来に比して高精度で実行できる医用画像処理装置等を提供すること。【解決手段】一実施形態に係る医用画像処理装置は、抽出手段、選択手段、決定手段を具備する。抽出手段は、複数の閾値のそれぞれを使用して、組織構造を表した医用画像データに対し閾値処理を実行することにより前記医用画像データから領域を抽出する。選択手段は、前記抽出された領域の中から、の所定条件を満たす領域を選択する。決定手段は、前記選択された領域に基づいて前記医用画像データにおける前記組織構造を表す領域を決定する。【選択図】図4