Provided are: a new protein deamidase that directly acts on side chain amide groups of asparagine residues in proteins, and that has the effect of disassociating side chain carboxyl groups and ammonia; a micro-organism producing said protein deamidase; a gene coding said protein; and a manufacturing method and application therefor. Bacteria that is classified in the actinobacteria class are cultured and made to produce protein deamidase, and the enzyme is harvested from the cultured product.Buluş, yeni bir protein deamidaza, enzim kodlayan polinükleotide, polinükleotidi içeren bir rekombinant vektöre, vektör ile birlikte sokulan bir dönüştürücüye, enzimi üretmek için bir yönteme ve enzim kullanılarak bir proteinin deamidasyonu için bir yönteme ilişkindir.