Compositions and methods for detecting Chlamydia trachomatis (CT) and Neisseria gonorrhoeae (NG) are provided. The present invention also provides methods and compositions for screening for infection/inflammation based on genomic copy number. Described herein is a method that entails assaying a sample obtained from the urogenital tract of the mammal for an indicator of genomic copy number, wherein a genomic copy number level that is higher than a control genomic copy number level is indicative of the presence of infection or inflammation of the urogenital tract. Also described in a kit of the invention that includes a primer and/or probe for detecting or sequencing an indicator of genomic copy number, wherein the indicator of genomic copy number comprises a nucleic acid sequence that is expected to be present in the genome of the mammal in one or two copies and a primer and/or probe for detecting or sequencing a nucleic acid sequence that is indicative of a pathogen that infects the urogenital tract or a miRNA correlated with inflammation.Cette invention concerne des compositions et des procédés de détection de Chlamydia trachomatis (CT) et Neisseria gonorrhoeae (NG). Cette invention concerne également des procédés et des compositions de criblage permettant de diagnostiquer une infection/inflammation sur la base du nombre de copies dans le génome. Le procédé ci-décrit consiste à doser un échantillon provenant des voies urogénitales dun mammifère pour obtenir un indicateur du nombre de copies dans le génome, un niveau du nombre de copies dans le génome qui est supérieur à celui dun mammifère témoin indiquant la présence dune infection ou dune inflammation des voies urogénitales. Un kit selon linvention est en outre décrit, ledit kit comprenant une amorce et/ou une sonde pour détecter ou séquencer un indicateur du nombre de copies dans le génome, lindicateur du nombre de copies dans le génome comprenant une séquence dacide nucléique supposée être présente dans le géno
