Compositions and methods are provided for detecting Chlamydia trachomatis (CT) and Neisseria gonorrhoeae (NG). The present invention also provides methods and compositions for screening for infection / inflammation based on genomic copy number. Involves assaying samples from the mammalian genitourinary tract for indicators of genomic copy number, a level of genomic copy number higher than that of the control genomic copy number indicating the presence of urogenital tract infection or inflammation A method is described herein. It is also a primer and / or probe for detecting or sequencing an index of genome copy number, wherein the index of genome copy number represents a nucleic acid sequence that is considered to be present in the mammalian genome in one or two copies. Also described are kits of the invention comprising primers and / or probes comprising, and primers and / or probes for detecting or sequencing a nucleic acid sequence indicative of a miRNA associated with a pathogen or inflammation that infects the genitourinary tract.クラミジア・トラコマチス(CT)およびナイセリア・ゴノレア(NG)を検出するための組成物および方法が提供される。本発明はまた、ゲノムコピー数に基づいて感染/炎症に関してスクリーニングするための方法および組成物も提供する。ゲノムコピー数の指標に関して哺乳動物の泌尿生殖路から得たサンプルをアッセイする工程を伴い、コントロールのゲノムコピー数のレベルよりも高いゲノムコピー数のレベルは泌尿生殖路の感染または炎症の存在を示す、方法が本願に記載される。また、ゲノムコピー数の指標を検出もしくは配列決定するためのプライマーおよび/またはプローブであって、ゲノムコピー数の指標は、1コピーまたは2コピーで哺乳動物のゲノム中に存在すると思われる核酸配列を含むプライマーおよび/またはプローブ、ならびに泌尿生殖路に感染する病原体もしくは炎症に関連するmiRNAを示す核酸配列を検出するもしくは配列決定するためのプライマーおよび/またはプローブを含む本発明のキットも記載される。