Quantitatively, through a first port providing access to a body cavity, a first 3D image of a first portion of the anatomy is inserted at a first location where it is captured from an endoscope viewpoint A system is provided that includes a three-dimensional (Q3D) endoscope. The first Q3D model is generated based on the captured first image. The endoscope is inserted into a second location where a second image of the second portion of the anatomy is captured via a second port that provides access to the body cavity. A second quantitative Q3D model is generated based on the captured second image. The first Q3D model and the second Q3D model are combined together to produce an expanded Q3D model of the anatomy. The extended Q3D model can be saved for further manipulation or displayed in 3D.体腔へのアクセスを提供する第1のポートを介して、解剖学的構造の第1の部分の第1の3D画像が内視鏡の視点から取り込まれる第1の位置に挿入される定量的な3次元(Q3D)内視鏡を含むシステムが提供される。第1のQ3Dモデルは、取り込んだ第1の画像に基づいて生成される。内視鏡は、体腔へのアクセスを提供する第2のポートを介して、解剖学的構造の第2の部分の第2の画像が取り込まれる第2の位置に挿入される。第2の定量的なQ3Dモデルが、取り込まれた第2の画像に基づいて生成される。第1のQ3Dモデル及び第2のQ3Dモデルは、解剖学的構造の拡張Q3Dモデルを生成するために一緒に組み合わされる。拡張Q3Dモデルは、更なる操作のために保存することができ、又は3Dで表示することができる。