Methods of modulating expression of a target nucleic acid in a cell are provided including use of multiple orthogonal Cas9 proteins to simultaneously and independently regulate corresponding genes or simultaneously and independently edit corresponding genes.L'invention concerne des procédés de modulation de l'expression d'un acide nucléique cible dans une cellule, lesdits procédés consistant à utiliser plusieurs protéines Cas9 orthogonales pour réguler simultanément et indépendamment des gènes correspondants ou pour éditer simultanément et indépendamment des gènes correspondants.