The functional analysis of genes frequently requires the manipulation of large genomic regions. A yeast- bacteria shuttle vector is described that can be used to clone large regions of DNA by homologous recombination. Also described is a method for isolating entire genomes, including chloroplast genomes, or large portions thereof, and manipulating the same. Also described are methods for determining minimal genomes, minimal pathway requirements, and minimal organelle genomes.Lanalyse fonctionnelle de gènes requiert fréquemment la manipulation de grandes régions génomiques. La présente invention concerne un vecteur de transfert levure-bactérie qui peut être utilisé pour cloner de grandes régions dADN par recombinaison homologue. La présente invention concerne en outre un procédé pour isoler des génomes entiers, comprenant des génomes de chloroplastes, ou de grandes portions de ceux-ci, et la manipulation de ceux-ci. La présente invention concerne en outre des procédés pour déterminer des génomes minimaux, des exigences de voie minimales, et des génomes dorganite minimaux.
