PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a fusion polypeptide containing FGFR3 polypeptide and BAIAP2 L1 polypeptide or TACC3 polypeptide.SOLUTION: As a result of detailed research into expression, over-amplification, mutation and translocation or the like of an FGFR coding gene in various kinds of cancer cell, a novel fusion polypeptide in which FGFR3 polypeptide is fused with another polypeptide in a plurality of cells derived from bladder cancer and lung cancer cells has been found out. There is also provided a method in which, by utilizing the fusion polypeptide as a biomarker in cancer treatment by an FGFR inhibitor, manifestation of adverse effect in the treatment by the FGFR inhibitor is preemptively prevented, a treatment mode can be controlled in order to obtain best treatment effect, and personalized medicine is made possible.【課題】FGFR3ポリペプチドと、BAIAP2L1ポリペプチド若しくはTACC3ポリペプチドとを含む融合ポリペプチドの提供。【解決手段】様々な癌細胞におけるFGFRコーディング遺伝子の発現、過増幅、変異および転座、等について詳細な研究を行い、複数の膀胱癌由来細胞および肺癌細胞において、FGFR3ポリペプチドが他のポリペプチドと融合した新規な融合ポリペプチド。融合ポリペプチドを、FGFR阻害剤による癌治療におけるバイオマーカーとして利用することにより、FGFR阻害剤による治療における副作用の発現を未然に防止し、且つ最善の治療効果が得られるよう治療態様をコントロールすることが可能であり、個別化医療が可能となる方法。【選択図】なし