The present disclosure pertains to a method and system configured for cough synchronization in a mechanical insufflation-exsufflation system. The system is configured to synchronize (712) the transition from an insufflation mode to an exsufflation mode to a patient initiated cough by detecting cough effort of the patient e.g. at the end of the insufflation phase. The detection of cough effort of the patient is based on one or more parameters associated with gas in the system. Upon detecting that the patient is initiating a cough, the system automatically switches the insufflation mode to the exsufflation mode to assist the patient to generate an effective cough.La présente invention concerne un procédé et un système configurés pour la synchronisation de la toux dans un système d'insufflation-exsufflation mécanique. Le système est configuré pour synchroniser (712) la transition d'un mode d'insufflation vers un mode d'exsufflation pour une toux initiée par un patient par détection d'effort de toux du patient, par exemple à la fin de la phase d'insufflation. La détection de l'effort de toux du patient est basée sur un ou plusieurs paramètres associés au gaz dans le système. Lors de la détection du fait que le patient est en cours d'initiation d'une toux, le système bascule automatiquement du mode d'insufflation vers le mode d'exsufflation pour aider le patient à générer une toux efficace.