An apparatus and method for analyzing brain diseases using MRI and fMRI are disclosed. The apparatus for analyzing brain diseases includes an image collecting unit for collecting MRI (Magnetic Resonant Image) and fMRI (functional MRI) from each of an experimental group and a control group related to brain diseases; A volume analyzer for calculating a volume of a brain region from the MRI of the test group and the control group to determine a first feature vector based on a volume difference between groups of the brain regions; An activity analyzer for calculating a degree of activation of the brain region from the fMRI of the experimental group and the control group to determine a second feature vector based on the difference in activation degree between the brain regions; And a feature extracting unit that extracts at least one of the first feature vector and the second feature vector as a feature vector for analyzing a brain disease.MRI 및 fMRI를 이용한 뇌 질환 분석 장치 및 방법이 개시된다. 뇌 질환 분석 장치는 뇌 질환과 관련된 실험군과 대조군 각각으로부터 MRI(Magnetic Resonant Image)과 fMRI(functional MRI)를 수집하는 영상 수집부; 상기 실험군과 대조군의 MRI로부터 뇌 영역의 부피를 계산하여 상기 뇌 영역의 그룹간 부피 차이에 기초한 제1 특징 벡터를 결정하는 부피 분석부; 상기 실험군과 대조군의 fMRI로부터 뇌 영역의 활성화도를 계산하여 상기 뇌 영역의 그룹간 활성화도 차이에 기초한 제2 특징 벡터를 결정하는 활성화도 분석부; 및 상기 제1 특징 벡터와 및 상기 제2 특징 벡터 중 적어도 하나의 특징 벡터를 뇌 질환을 분석하기 위한 특징 벡터로 추출하는 특징 추출부를 포함할 수 있다.