Provided are a mitochondrial targeting contrast agent molecule and use thereof as a T 2 contrast agent. The mitochondrial targeting contrast agent molecule comprises a phosphonium cation of formula -P +(X 1)(X 2)(X 3) for binding to cell mitochondria, and a superparamagnetic metal complex,which is a contrast unit for enhencing contrast during magnetic resonance imaging. Also provided is a mitochondrial targeting contrast agent molecule, in which one or more cations of -P +(X 1)(X 2)(X 3) are bound with 1 to 8 superparamagnetic metal complex molecules through branch or linear molecules, while linker and spacer are used to improve the spatial structure between the cation -P +(X 1)(X 2)(X 3) and the branched or linear molecule and that between the branched or linear molecule and the superparamagnetic metal complex. Meanwhile, provided are magnetic labeled cells labeled with the contrast molecules, a combination of the magnetically labeled cells and scaffold materials, a method for preparing the contrast agent molecule, and a method of magnetic resonance imaging tracing in vivo by using the above materials.L'invention concerne une molécule d'agent de contraste de ciblage mitochondrial et son utilisation comme agent de contraste T 2. La molécule d'agent de contraste de ciblage mitochondrial comprend un cation phosphonium de formule -P +(X 1)(X 2)(X 3) pour la liaison à des mitochondries de cellule, et un complexe métallique superparamagnétique, qui est une unité de contraste pouvant améliorer le contraste en imagerie par résonance magnétique. L'invention concerne également une molécule d'agent de contraste de ciblage mitochondrial, un ou plusieurs cations de -P +(X 1)(X 2)(X 3) étant liés avec 1 à 8 molécules de complexe métallique supraparamagnétique par le biais de molécules linéaires ou ramifiées, un lieur et un espaceur étant utilisés pour améliorer la structure spatiale entre le cation -P +(X 1)(X 2)(X 3) et la molécule linéaire ou ramifiée et celle entre la molécul