For example, the present invention, physical mutual between the tim-2 ligand and tim-2 or between the tim-4 and tim-1 or factors that modulate the activity of tim-4 or tim-1, tim-2 by administering to the subject an agent that modulates the activity, to a method of modulating an immune response in a subject. The immune response, autoimmune disorders, transplantation tolerance, and impaired responses and Th2-mediated disorders and response and Th1-mediated including but not limited to. The invention also relates to novel assays for identifying agents that modulate the physical interactions between the tim-4 and tim-1. The invention further relates to nucleic acids encoding the same, and novel soluble tim-4 polypeptide.本発明は、例えば、tim-1、tim-2もしくはtim-4の活性を調節する因子またはtim-1とtim-4との間もしくはtim-2とtim-2リガンドとの間の物理的相互作用を調節する因子を被験体に投与することにより、被験体における免疫応答を調節する方法に関する。免疫応答としては、自己免疫障害、移植寛容、ならびにTh1媒介性の応答および障害およびTh2媒介性の応答および障害が挙げられるがこれらに限定されない。本発明はまた、tim-1とtim-4との間の物理的相互作用を調節する因子を同定するための新規アッセイに関する。さらに、本発明は、新規可溶性tim-4ポリペプチドおよびこれをコードする核酸に関する。