The fluorescence observation endoscope system includes light in a first wavelength band as fluorescence emitted by irradiating a medicine administered to a living body, light in a second wavelength band as visible light, light in a third wavelength An image pickup section having an image pickup element which simultaneously receives fluorescence and reflected light of second and third wavelength bands an image pickup section which picks up fluorescence obtained by the image pickup section And a signal processing device that generates a color display image to be displayed in different colors from the first and second image signals acqu from the reflected light of the second and third wavelength bands.蛍光観察内視鏡システムは、生体に投与した薬剤に照射することで発光した蛍光としての第1の波長帯域の光と、可視光であって第2の波長帯域の光と、第3の波長帯域の光と、を同時に出射可能な光源装置と、蛍光と第2及び第3の波長帯域の光の反射光とを同時に受光する撮像素子を有する撮像部と、撮像部が取得した蛍光の撮像信号と、第2及び第3の波長帯域の光の反射光から取得した第2及び第3の撮像信号とから、それぞれ異なる色で表示するカラー表示画像を生成する信号処理装置と、を備える。
