本发明公开了一种糖基转移酶突变蛋白及其应用。具体地,本发明利用同源比对以及定点突变,发现了一种新的糖基转移酶的突变蛋白,所述的突变蛋白为非天然蛋白,且所述突变蛋白具有糖基转移酶催化活性,并且所述突变蛋白含有与酶催化活性相关的以下核心氨基酸:第142位氨基酸为A;第144位氨基酸为H或F;和第339位氨基酸为G;其中,所述氨基酸位置编号基于SEQ ID NO.:13所示的序列。实验证明,对糖基转移酶中的关键位点进行改造后,可以改变原本无活性或活性较差的酶,或者赋予新的酶活性。此外,本发明人还发现,对本发明糖基转移酶进行末端截短后,其表达量具有明显的上升。