The present invention relates to a method of manufacturing a functional spring onion syrup. The method includes: a step (a) of preparing a spring onion root ingredient by sorting and washing spring onion roots; a step (b) of steaming the spring onion root ingredient to make steamed spring onion roots; a step (c) of making dried spring onion roots by drying the steamed spring onion roots; a step (d) of making spring onion root powder by grinding the dried spring onion roots; and a step (e) of making functional syrup including spring onion root components by mixing the spring onion root powder with rice syrup. As such, the spring onion root syrup, manufactured through the method, is capable of reducing the spicy taste of spring onion root components, preventing a cold by boosting immunity, and increasing the content of polysaccharide with changed ingredients for grain syrup.본 발명은 (a) 파뿌리를 분류하고, 세척하여 파뿌리 원료를 준비하는 단계; (b) 상기 파뿌리 원료를 쪄서 찐 파뿌리를 제조하는 단계; (c) 상기 찐 파뿌리를 건조하여 건조된 파뿌리를 제조하는 단계; (d) 상기 건조된 파뿌리를 파쇄하여 파뿌리 분말을 제조하는 단계; 및 (e) 상기 파뿌리 분말을 쌀 조청과 혼합하여 파뿌리 성분을 포함하는 기능성 조청을 제조하는 단계;를 포함하는 기능성 파뿌리 조청의 제조방법에 관한 것이다. 이에 의하여, 본 발명의 기능성 파뿌리 조청의 제조방법에 따라 제조된 조청은 파뿌리 성분의 매운맛이 저감되고, 면역력을 증강시켜 감기 예방 등의 효과가 있으며, 조청의 제조 원료에 변화를 가하여 다당류의 함량을 증가시킬 수 있다.