Disclosed herein are methods and compositions for treating Huntington's Disease. In particular, provided herein are methods and compositions for modifying (e.g., modulating expression of) an HD Htt allele so as to treat Huntington Disease. Also provided are methods and compositions for generating animal models of Huntington's Disease. Thus, in one aspect, engineered (non-naturally occurring) DNA binding domains (e.g., zinc finger proteins, TAL effector (TALE) proteins or CRISPR/dCas-TF) that modulate expression of a HD allele (e.g., Htt) are provided.Resumen: En la presente se describen métodos y composiciones para tratar la enfermedad de Huntington. En particular, se proporcionan en la presente métodos y composiciones para modificar (por ejemplo, modular la expresión de) un alelo HD de htt para tratar la enfermedad de Huntington. También se proporcionan métodos y composiciones para generar modelos animales de la enfermedad de Huntington. De este modo, en un aspecto, se proporcionan dominios de unión al ADN diseñados, es decir, que no ocurren de manera natural, (por ejemplo: proteínas de dedo de zinc, proteínas de efector TAL [TALE, por sus siglas en inglés] o CRISPR/dCas-TF) que modulan la expresión de un alelo HD, por ejemplo, htt.