Plant-derived protein is provided a method of manufacturing the protein or superstructure. The method Apo plast - generating a piece of obtaining a protein or superstructure plant or plant material containing a protein goods step, Pro from the plant or plant material protoplast / spheroplast fraction and a spore plast-fraction, and It may comprise the step of recovering the Apo plast fraction. Apo plast fraction is plant-derived protein may comprise a protein or superstructure. Alternatively, the protein or superstructure protein using the cell wall degrading enzyme composition plants by decomposing plant material-decomposition to produce a fraction get from plants or plant materials, including proteins derived protein or superstructure. The decomposed fraction is filtered to produce a filtered fraction, plant-derived proteins or superstructure protein is recovered from the filtered fraction.식물-유래 단백질 또는 상부구조물 단백질의 제조방법이 제공된다. 본 방법은 아포플라스트-편재화된 단백질 또는 상부구조물 단백질을 포함하는 식물 또는 식물 물질을 얻는 단계, 식물 또는 식물 물질로부터 프로토플라스트/스페로플라스트 분획 및 아포플라스트 분획을 생성하는 단계, 및 아포플라스트 분획을 회수하는 단계를 포함할 수 있다. 아포플라스트 분획은 식물-유래 단백질 또는 상부구조물 단백질을 포함할 수 있다. 대안으로 단백질 또는 상부구조물 단백질은 세포벽 분해 효소 조성물을 사용하여 식물 물질을 분해함으로써 식물-유래 단백질 또는 상부구조물 단백질을 포함하는 식물 또는 식물 물질로부터 얻어서 분해된 분획을 생성한다. 분해된 분획은 여과되어 여과된 분획을 생성하고, 식물-유래 단백질 또는 상부구조물 단백질은 여과된 분획으로부터 회수된다.