This medical manipulator system includes: a master manipulator a slave manipulator a first image forming device configured to acquire a first image a second image forming device configured to form a second image a display device configured to display the first image and the second image a selection means configured to select one image from the first image and the second image a transforming means configured to transform the operating command sent by the master manipulator to a corresponding new command such that the selected image coordinate system coincides with the operational coordinate system being used by the master manipulator and a driving means configured to cause the slave manipulator to move in accordance with the new command.Ce système de manipulateur médical comprend : un manipulateur maître un manipulateur esclave un premier dispositif de formation dimage configuré pour acquérir une première image un second dispositif de formation dimage configuré pour former une seconde image un dispositif daffichage configuré pour afficher la première image et la seconde image un moyen de sélection configuré pour sélectionner une image à partir de la première image et de la seconde image un moyen de transformation configuré pour transformer la commande de fonctionnement envoyée par le manipulateur maître à une nouvelle commande correspondante de telle sorte que le système de coordonnées dimage choisie coïncide avec le système de coordonnées fonctionnel qui est utilisé par le manipulateur maître et un moyen dentraînement configuré pour amener le manipulateur stable à se déplacer conformément à la nouvelle commande.