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相互作用エネルギーの算出方法、及び算出装置、並びにプログラム
专利权人:
富士通株式会社
发明人:
佐藤 博之
申请号:
JP20150219834
公开号:
JP2017091179(A)
申请日:
2015.11.09
申请国别(地区):
日本
年份:
2017
代理人:
摘要:
【課題】考慮する水分子を適切に選択でき、かつ計算時間の短縮化が可能な相互作用エネルギーの算出方法を提供する。【解決手段】標的分子と、薬候補分子と、前記標的分子及び前記薬候補分子の周囲の複数の水分子とを用いて、第1の分子動力学計算を行う工程と、前記第1の分子動力学計算により得られる、前記標的分子及び前記薬候補分子の複合体の構造の時間変化に基づいて、前記複合体の構造の時間変化を代表する1以上の代表構造を決定する工程と、前記代表構造について、前記薬候補分子を拘束し、かつ前記標的分子において前記薬候補分子から相対的に離れた部分構造を拘束しながら、第2の分子動力学計算を行う工程と、前記第2の分子動力学計算の結果を用いて、水分子を抽出する工程と、抽出された前記水分子を考慮して、前記標的
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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