Methods for detecting inflammatory or autoimmune conditions, comprising analyzing bacterial L-serine containing lipids in a sample and, comparing results of the analysis of the bacterial L-serine containing lipids in the sample with information on occurrence of the bacterial L-serine containing lipids in a control sample, wherein a decreased occurrence of the bacterial L-serine containing lipids in the test sample over the occurrence of bacterial L-serine containing lipids in the control sample indicates the presence of an inflammatory or an autoimmune condition, are described herein. An example of the autoimmune condition is multiple sclerosis (MS). The use of bacterial L-serine containing lipids as biomarkers for detection of MS is described. Antibodies specific to L-serine containing lipids and their uses are also provided. Also provided are compositions comprising bacterial L-serine containing lipids for modulating immune responses or TLR pathways in humans, animals, and human or animal cells or tissues.Linvention concerne des méthodes permettant de détecter des affections inflammatoires ou auto-immunes consistant à analyser des lipides bactériens contenant de la L-sérine dans un échantillon et à comparer les résultats de lanalyse desdits lipides dans léchantillon avec des informations sur loccurrence desdits lipides dans un échantillon témoin, une réduction de loccurrence desdits lipides dans léchantillon étudié par rapport à loccurrence desdits lipides dans léchantillon témoin indiquant la présence dune affection inflammatoire ou auto-immune. Laffection auto-immune est par exemple la sclérose en plaques (SEP). Linvention concerne également lutilisation de lipides bactériens contenant de la L-sérine comme biomarqueurs de détection de la SEP, des anticorps spécifiques de lipides bactériens contenant de la L-sérine et leurs utilisations, et des compositions comprenant des lipides bactériens contenant de la L-sérine pour moduler les réponses immunitaires ou les v