An alignment unit (26) that aligns the acquired positional information of the imaging system with 3D information of the luminal organ, and imaging that calculates an imaging position in the 3D information at the time of image acquisition based on the aligned positional information A position calculation unit (27), an imaging information storage unit (22) for storing an imaging position and an image in association with each other, an operation unit (40) for designating an area in 3D information, and the imaging information storage unit (22). A medical device system, comprising: an image processing unit (21) that acquires an image of an imaging position that overlaps a specified region from a storage result and arranges the image according to a predetermined reference for each region.取得された撮像系の位置情報を管腔臓器の３Ｄ情報に位置合わせする位置合わせ部（２６）と、画像取得時の３Ｄ情報中における撮像位置を、位置合わせされた位置情報に基づき算出する撮像位置算出部（２７）と、撮像位置と画像を関連付けて記憶する撮像情報記憶部（２２）と、３Ｄ情報中の領域等を指定する操作部（４０）と、撮像情報記憶部（２２）の記憶結果から、指定領域に重なる撮像位置の画像を取得して領域毎に所定の基準で並べる画像処理部（２１）と、を有する医療機器システム。
