A method of and system for monitoring a patient's EEG (electroencephalogram) during TMS (Transcranial Magnetic Stimulation) are disclosed. The system comprises a TMS device to generate, when in an active state, a plurality of magnetic pulses, which can be applied either as a burst, comprising a plurality of pulses grouped together, or as individual pulses, to the patient's head, in accordance with a TMS treatment protocol. An EEG system is provided to measure EEG data resulting from the TMS treatment protocol being applied to the patient. The system further comprises control means in communication with the TMD device and the EEG system, the control means being arranged to activate the EEG system during the time periods when the TMS device is not generating pulses, such that the EEG data measurement is continuously applied or interleaved with the magnetic pulses being generated in accordance with the TMS treatment protocol, so as to monitor treatment efficacy and detect potential seizures.L'invention concerne un procédé et un système pour surveiller un électroencéphalogramme (EEG) d'un patient pendant une stimulation magnétique transcrânienne (TMS). Le système comprend un dispositif TMS pour générer, dans un état actif, une pluralité d'impulsions magnétiques qui peuvent être appliquées soit sous forme de rafale, comprenant une pluralité d'impulsions regroupées ensemble, soit sous forme d'impulsions individuelles, à la tête du patient, selon un protocole de traitement TMS. Un système EEG est conçu pour mesurer des données EEG résultant du protocole de traitement TMS appliqué au patient. Le système comprend en outre des moyens de commande en communication avec le dispositif TMS et le système EEG, les moyens de commande étant conçus pour activer le système EEG pendant les périodes pendant lesquelles le dispositif TMS ne génère pas d'impulsions, de telle sorte que la mesure de données EEG est appliquée ou intercalée de façon continue avec les impulsions magnétiques qui s