This disclosure provides microwell capsule array devices. The microwell capsule array devices are generally capable of performing one or more sample preparation operations. Such sample preparation operations may be used as a prelude to one more or more analysis operations. For example, a device of this disclosure can achieve physical partitioning and discrete mixing of samples with unique molecular identifiers within a single unit in preparation for various analysis operations. The device may be useful in a variety of applications and most notably nucleic-acid-based sequencing, detection and quantification of gene expression and single-cell analysis.La présente invention concerne des dispositifs à réseau de capsule de micropuits. Les dispositifs à réseau de capsule de micropuits sont, d'une manière générale, des dispositifs susceptibles d'effectuer une ou plusieurs opérations de préparation d'échantillon. De telles opérations de préparation d'échantillon peuvent être utilisées en tant que début d'une ou de plusieurs opérations d'analyse. Par exemple, un dispositif de la présente invention permet d'obtenir une séparation physique et un mélange des échantillons discrets avec des identifiants moléculaires uniques à l'intérieur d'une unité unique dans la préparation de diverses opérations d'analyse. Le dispositif peut être utile dans un large panel d'applications et notamment le séquençage à base d'acides nucléiques, la détection et la quantification de l'expression génique et l'analyse de cellules uniques.