A functional image creation method and a functional image creation apparatus capable of drawing an activation region are provided. The phase difference image PDr using the complex image σr (x) created from the MR signal when inactive and the complex image σ′r (x) obtained by filtering the complex image σr (x). (X) is created. A phase difference image PDa () using a complex image σa (x) created from an MR signal at the time of active and a complex image σ′a (x) obtained by filtering the complex image σa (x). x) is created. Functional signal images diff1 (x) and diff2 (x) are created using the phase difference image PDr (x) and the phase difference image PDa (x). The function signal image diff1 (x) or the function signal image diff2 (x) is masked by the intensity image Mr (x), the intensity image Ma (x), the standard image, or the morphological image I (x), and the activation area is drawn. A functional image I ′ (x) is created.賦活領域を描画することの可能な機能画像作成法および機能画像作成装置を提供する。非活動時のMR信号から作成された複素画像σr(x)と、複素画像σr(x)に対してフィルタ処理の施された複素画像σ’r(x)とを利用して位相差画像PDr(x)が作成される。活動時のMR信号から作成された複素画像σa(x)と、複素画像σa(x)に対してフィルタ処理の施された複素画像σ’a(x)とを利用して位相差画像PDa(x)が作成される。位相差画像PDr(x)と位相差画像PDa(x)とを利用して機能信号画像diff1(x)、diff2(x)が作成される。機能信号画像diff1(x)または機能信号画像diff2(x)が、強度画像Mr(x)、強度画像Ma(x)、標準画像もしくは形態画像I(x)にマスクされ、賦活領域が描画された機能画像I’(x)が作成される。